Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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