Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPN6Q9Y6Q1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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