Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms