Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms