Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRG3Q9Y2Y8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms