Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA4Q9UN74 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms