Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARX2Q9UMQ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms