Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSEQ9UL01 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSEQ9UL01 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms