Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RCAN3Q9UKA8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN3Q9UKA8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms