Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms