Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA1Q9UIW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms