Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms