Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms