Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms