Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PHRF1Q9P1Y6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms