Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23BQ9NYZ1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms