Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms