Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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