Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRMT1Q9NXH9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms