Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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