Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCF3Q9NUQ8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCF3Q9NUQ8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms