Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1Q9NUN5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms