Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINM1Q9NU53 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms