Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASSF1Q9NS23 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASSF1Q9NS23 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms