Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMC2Q9NRP2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms