Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX2Q9NRD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX2Q9NRD8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms