Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BIN3Q9NQY0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms