Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC17Q9NP64 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms