Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXNA4Q9HCM2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXNA4Q9HCM2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXNA4Q9HCM2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXNA4Q9HCM2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXNA4Q9HCM2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms