Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms