Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms