Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms