Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms