Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN1Q9BY11 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms