Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms