Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRIP1Q9BX63 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIP1Q9BX63 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms