Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms