Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms