Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms