Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNS3Q9BQ31 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms