Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPA33Q99795 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms