Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms