Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYCBPQ99417 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYCBPQ99417 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms