Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGAP1Q96PV0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms