Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC138Q96M89 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms