Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PRAC1Q96KF2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms