Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms