Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms