Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms