Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms